کشورهای حوزه خلیج فارس در پاره ای مسائل دارای وجوه اشتراک هستند و در برخی امور نیز با هم در تعرض و اختلاف بسر می برند. عوامل تنش زا و موانع موثر در عدم همگرایی کشورهای حاشیه خلیج فارس را می توان به دو گروه درون منطقه ای و برون منطقه ای تقسیم نمود. تمایزات فرهنگی، تمایزات سیاسی، اختلافات ارضی و مرزی، تمایزات اجتماعی و اقتصادی و تبلیغات و دیدگاه های منفی از عمده ترین موانع داخلی عدم همگرایی می باشند و مهم ترین عوامل فرامنطقه ایی را باید حضور موثر و مداخله گرایانه ابرقدرت ها در منطقه دانست. حضور منفعت طلبانه و سودجویانه کشورهایی چون آمریکا، شوروی سابق، انگلیس، فرانسه و... شاهدی براین مدعاست. از موارد مهم مورد اختلاف در حوزه خلیج فارس باید به اختلاف های ارزی و مرزی اشاره کرد. شاید در هیچ منطقه ایی از جهان به اندازه خلیج فارس، اختلافات مرزی و ارضی وجود نداشته باشد. بیش از 50 مورد اختلافات مرزی و ارضی در میان 8 کشور حاشیه خلیج فارس وجود داشته و دارد و این مساله تاکنون موجبات جندین جنگ و درگیری نظامی و مسلحانه را پدید آورده است. یکی از موارد مورد مناقشه که هنوز به قوت خود باقی است، مساله حاکمیت ایران بر جزایر سه گانه می باشد که در این نوشتار پرداخته شده است.